Уменьшение суммы к оплате по контракту по начисленным штрафным санкциям

Мы являемся казенным учреждением. Заключили договор на поставку оборудования. Поставщик нарушил сроки поставки, мы выставили ему сумму на оплату штрафа. Поставщик предлагает, чтобы мы вернули ему сумму обеспечения контракта меньше на сумму штрафа. Как это отразить в бухгалтерском учете? Либо оплату по договору (по выставленному счету ) оплатить меньше на сумму штрафа?